Affymetrix表達譜芯片

浏览量: 128   / 时间:2019-12-15   /作者:线上体育平台

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目前仍缺乏治療三陰性乳腺癌(TNBC)的有效手段,其中,紫杉醇耐藥是治療主要的障礙之一。已證實選擇性剪接的失調可能會導致腫瘤發展和化療耐藥。人類選擇性剪接調控基因TRA2有兩個旁系同源基因分別負責編碼TRA2A和TRA2B,已有研究證明TRA2B與癌細胞存活和治療敏感性有關,但TRA2A在腫瘤發展中發揮的功能尚不清楚。

歐易生物攜手天津醫科大學,對過表達TRA2A的細胞株和正常細胞株進行表達譜芯片篩選,分析TRA2A調控的可變剪接。最終研究表明三陰性乳腺癌中TRA2A可以增強癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力。此外,TRA2A可以通過調控與癌相關的可變剪接增強乳腺癌細胞對紫杉醇的抗性。

1.對正常乳腺癌細胞和紫杉醇抗性乳腺癌細胞株進行表達譜芯片篩選,發現抗性細胞株中TRA2A特異性高表達。2.驗證TRA2A的功能,發現過表達TRA2A可以促進癌細胞遷移和侵襲。3.通過表達譜芯片進行可變剪接篩選,篩選得到7個候選基因,隨后,紫杉醇處理癌細胞后發現其中的三個基因(CALU、RSRC2和PALM)發生可變剪接,表明紫杉醇抗性細胞株中TRA2A主要調控CALU、RSRC2和PALM的可變剪接。4.臨床組織樣本驗證TRA2A的表達和CALU、RSRC2和PALM的可變剪接,發現TRA2A的表達與三陰性乳腺癌病人生存率、腫瘤發展階段以及紫杉醇抗性等密切相關。在腫瘤復發和轉移組織樣本中發現,RSRC2的兩個轉錄本中RSRC21高表達而RSRC2s低表達。對RSRC2s進行功能驗證,結果表明RSRC2s的敲降增強了細胞對紫杉醇的耐藥性。5.通過PubMed發現RSRC2中RSRC21保留了第四個外顯子,該外顯子含有一個提前終止密碼子,使得RSRC21不能正常翻譯成功能蛋白。隨后,作者通過可變剪接微基因報告方法證明了TRA2A通過調控可變剪接使得RSRC21高表達RSRC2s低表達,從而抑制功能蛋白的表達。

參考文獻LiuT,SunH,ZhuD,etal.TRA2APromotedPaclitaxelResistanceandTumorProgressioninTriple-NegativeBreastCancersviaRegulatingAlternativeSplicing.MolCancerTher2017;16(7):1377-1388.(IF:5.579)