單細胞ATACseq

浏览量: 194   / 时间:2019-12-15   /作者:线上体育平台

1、2015年,斯坦福大學WilliamGreenleaf和HowardYChang繼續發力,通過將ATAC-seq結合微流控技術,推出了升級版本單細胞ATAC-seq(scATAC-seq),文章發表于Nature。

在scATAC-seq中,通過一個程序化的微流控平臺捕獲單個細胞,隨后在一個整合的流體學集成環路(integratedfluidicscircuit,IFC)上進行轉座酶切和PCR,回收文庫,并通過帶有barcode的引物進行PCR擴增;隨后將單細胞的文庫混合并進行高通量測序。

2、目前單細胞測序最常用的平臺為10xGenomics。2019年3月,嘉因生物單細胞ATAC-seq通過美國10xGenomics公司的CSP認證,成為全球第一家經過10xGenomics官方認證的ChromiumSingleCellATACSolution服務商。

單細胞ATAC-seq實現了單細胞染色質開放性的可視化,單細胞RNA-seq實現了單細胞基因表達水平的可視化,二者相結合可在轉錄水平和轉錄后水平全面了解基因調控網絡。為此,公司還推出單細胞ATAC-seq和單細胞RNA-seq聯合項目,進一步幫助研究人員從單細胞水平深入挖掘基因表達動態調控機制。

自2019年3月起,嘉因生物正式在全國范圍內開展了單細胞ATAC-seq和單細胞RNA-seq上門服務,樣本覆蓋了小鼠脾臟組織、小鼠肺臟T細胞、人肝癌及癌旁組織、人胎盤組織等等。目前下機的正式項目中,數據質量全部達標,歡迎各位研究人員前來咨詢探討!