高通量测序技术解析冠状病毒

浏览量: 153   / 时间:2020-03-12   /作者:线上体育平台

线上体育平台在做好第一步的防控疫情后,接下来做好关于抗病毒药物的研发,而病毒药物的研发首先要求我们了解病毒的基本信息,此时基因组与转录组的高通量测序技术均发挥了重要作用。2月3日,Nature杂志在线发表题目为Apneumoniaoutbreakassociatedwithanewcoronavirusofprobablebatorigin的学术论文,该文献通过基因组的高通量测序技术发现在其中5名病人身上获取的全长度基因组序列彼此之间相似度超过99.9%,与SARS冠状病毒有约79.5%的序列一致。此外,线上体育平台研究人员发现该新型冠状病毒序列与一种蝙蝠冠状病毒在全基因组水平上相似度高达96%,表明蝙蝠可能是该新型冠状病毒的来源(图2)。

无独有偶,2月3日,Nature杂志在线发表题目为AnewcoronavirusassociatedwithhumanrespiratorydiseaseinChina的学术论文,之后同样是通过基因组高通量测序技术将该新型病毒基因组进行测序,同时对完整病毒基因组(29,903个核苷酸)的系统进化分析表明,该病毒与一组SARS样冠状病毒与一种中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关,达到89.1%核苷酸相似性。PNAS发表的一篇题目为RNAsequencingbydirecttagmentationofRNA/DNAhybrids的学术论文,该论文提及的转座酶建库的方案则是在转录组层面解析新型冠状病毒。该实验可在100pg的RNA起始量时检测近9000个基因。

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